偏光顯微鏡是研究透明礦物光學性質的主要儀器。與一般的生物顯微鏡相比，最主要的區別是有兩個偏光鏡。其中，一個安裝在載物臺之下，稱下偏光，另一個安裝在載物臺之上的鏡筒中，稱上偏光。在偏光顯微鏡中，上偏光的振動方向是固定的，而下偏光的振動方向是可以調節的。一般來說，兩個偏光的振動方向是相互垂直的。
偏光顯微鏡的調節與校正時，第一步要先對目鏡和物鏡進行調節。對于只有一個目鏡筒的偏光顯微鏡，只要將選用的目鏡插入鏡筒，使目鏡十字絲位于左右、上下方向即可。對于具有雙目鏡筒的偏光顯微鏡，還需調節兩個目鏡之間的距離，使眼睛間距與雙筒視線一致。因顯微鏡類型不同，物鏡的裝卸有下列幾種情況：彈簧夾型、轉盤型、螺絲扣型。
第二步，調節照明系統。分以下兩種情況：1)有自然光照明，則需要調節反光鏡。反光鏡有平面鏡和凹面鏡兩種。2)用人工光源照明，如OLYMPUS和ZEISS等高級顯微鏡都用人工光源照明，需要調節電壓旋鈕，電壓越高，亮度越大。
第三步，調節焦距。調焦時，需從側面看鏡筒，轉動粗調旋鈕，將鏡頭降至最下面位置，若用高倍鏡頭，需將鏡頭降至幾乎與薄片接觸為止，然后從鏡中觀測，同時轉動粗旋鈕緩緩提升鏡頭至視域內物像基本清楚，在轉動微調旋鈕，直至視域內物像清晰為止。須注意的是，調焦時，絕不能眼睛看著鏡筒內下降鏡第四步，校正中心。
第五步，視域直徑的測定。分三種情況：1)對于低倍或中倍物鏡的視域直徑，可用透明三角板直接測定。2)對于高倍物鏡的視域直徑，可用物臺微尺測定。3)對于帶有刻度的目鏡，可直接測定。
第六步，目鏡十字絲的檢查。主要檢查目鏡十字絲是否正交。因為目鏡十字絲正交與否關系到偏光顯微鏡中的上、下偏光的振動方向是否垂直。
第七步，偏光鏡的校正，有以下三個內容：1)確定及校正下偏光鏡的振動方向。2)檢查上、下偏光鏡的振動方向是否垂直。3) 檢查目鏡十字絲是否嚴格與上、下偏光振動方向一致。
